RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.4■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.39■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.39■■□□□ 1.5
IMP4-208ENST00000460766 OFD1O75665 1012 aa24.39■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 COL18A1P39060 1754 aa24.38■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 CHGBP05060 677 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 STK3Q13188 491 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 FERMT3Q86UX7 667 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 JCADQ9P266 1359 aa24.37■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 ABCC6O95255 1503 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 COL15A1P39059 1388 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 PDCP20941 246 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 CASP7P55210 303 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 MCM5P33992 734 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 KRT32Q14532 448 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 UVSSAQ2YD98 709 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 HAUS7Q99871 368 aa24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 DCCP43146 1447 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 NBPF26B4DH59 902 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 NBPF14Q5TI25 921 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 NBPF15Q8N660 670 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 USP25Q9UHP3 1055 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 KRT85P78386 507 aa24.34■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 ZNF609O15014 1411 aa24.33■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.33■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 NEK1Q96PY6 1258 aa24.33■■□□□ 1.49
IMP4-208ENST00000460766 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.32■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.32■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 FOXO4P98177 505 aa24.32■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.32■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.31■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 H7C1W4 665 aa24.31■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.31■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 TPM2P07951 284 aa24.3■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.3■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 TTC6Q86TZ1 520 aa24.3■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 CPDO75976 1380 aa24.3■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.3■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 A1BGP04217 495 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 CYP21A2P08686 494 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZUG5 572 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 MPNDQ8N594 471 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.29■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 GOLIM4O00461 696 aa24.28■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 ADCY5O95622 1261 aa24.28■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.28■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.28■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 TIMM10P62072 90 aa24.28■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 GTF3C6Q969F1 213 aa24.27■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 JAK2O60674 1132 aa24.27■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 FGD1P98174 961 aa24.27■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 PLCB2Q00722 1185 aa24.27■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.27■■□□□ 1.48
IMP4-208ENST00000460766 GLI3P10071 1580 aa24.26■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.26■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.26■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 ELP1O95163 1332 aa24.25■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.25■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 SPATA32Q96LK8 384 aa24.25■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.25■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 BRF1Q92994 677 aa24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.24■■□□□ 1.47
IMP4-208ENST00000460766 KDM4AO75164 1064 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms