RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 COL15A1P39059 1388 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 RNF20Q5VTR2 975 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 MAP4K1Q92918 833 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 HMG20BQ9P0W2 317 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL1-203ENST00000439248 ITGB4P16144 1822 aa17.02■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 TNS2Q63HR2 1409 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 BARGINQ6ZT62 677 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 FUCA2Q9BTY2 467 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 MTMR6Q9Y217 621 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 EXOC5O00471 708 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 GRM8O00222 908 aa17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CHAMP1Q96JM3 812 aa17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 USP25Q9UHP3 1055 aa17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 EP400Q96L91 3159 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 DDB1Q16531 1140 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 DCAF5Q96JK2 942 aa16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 A0A0G2JS52 829 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 KDM4AO75164 1064 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 GJB2P29033 226 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 RNF214Q8ND24 703 aa16.98■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 KRT32Q14532 448 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 MED23Q9ULK4 1368 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 PTH1RQ03431 593 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC125Q86Z20 511 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 SPTLC3Q9NUV7 552 aa16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 KRT85P78386 507 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 AACSQ86V21 672 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL1-203ENST00000439248 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.95■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 KCNQ3O43525 872 aa16.95■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC192P0DO97 292 aa16.95■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.95■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.95■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 UQCRHLA0A096LP55 91 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 ADCY5O95622 1261 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 CAVIN2O95810 425 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 UQCRHP07919 91 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC83Q8IWF9 413 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 SLC27A2O14975 620 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 SASH1O94885 1247 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 CABP4P57796 275 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 ME3Q16798 604 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 ADCK5Q3MIX3 580 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 COPRSQ9NQ92 184 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 FIBPO43427 364 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 LARGE1O95461 756 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 RPS6KB1P23443 525 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 SLC39A6Q13433 755 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 KAZALD1Q96I82 304 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 SUCLG2Q96I99 432 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 PAPPAQ13219 1627 aa16.92■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 ATP5JP18859 108 aa16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 KCNJ4P48050 445 aa16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 ST3GAL1Q11201 340 aa16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 C5P01031 1676 aa16.91■□□□□ 0.3
TTLL1-203ENST00000439248 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms