RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 NTSR2O95665 410 aa27.06■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 AK7Q96M32 723 aa27.06■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 PDE8AO60658 829 aa27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 TNNI3KQ59H18 835 aa27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 EYA2O00167 538 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 POTEAQ6S8J7 498 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 FBXO41Q8TF61 875 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 NARFQ9UHQ1 456 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 C4AP0C0L4 1744 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.04■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 ITGA6P23229 1130 aa27.03■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.03■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 AK9Q5TCS8 1911 aa27.03■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 ZPR1O75312 459 aa27.02■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 GPATCH3Q96I76 525 aa27.02■■□□□ 1.92
VSX1-205ENST00000429762 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.99■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 ERC2O15083 957 aa26.99■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 CIAO1O76071 339 aa26.99■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 ERFEQ4G0M1 354 aa26.99■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 CASC1Q6TDU7 716 aa26.99■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.98■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 PROM2Q8N271 834 aa26.98■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 LAMB2P55268 1798 aa26.98■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.98■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 RFC4P35249 363 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 TXNRD1Q16881 649 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 CHMLP26374 656 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 TIMM10P62072 90 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.97■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 APBA3O96018 575 aa26.96■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.96■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 ZNF609O15014 1411 aa26.96■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.95■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 CNTROBQ8N137 903 aa26.95■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.95■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.95■■□□□ 1.91
VSX1-205ENST00000429762 SLC4A3P48751 1232 aa26.95■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.95■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.94■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.94■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 ABCC12Q96J65 1359 aa26.94■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 CASZ1Q86V15 1759 aa26.94■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.94■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 SPEF2Q9C093 1822 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 SETDB2Q96T68 719 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 COL4A1P02462 1669 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 IL25Q9H293 177 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 A0A1B0GUL7 405 aa26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 METTL24Q5JXM2 366 aa26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 GPR108Q9NPR9 543 aa26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 LRP5O75197 1615 aa26.91■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 RGL2O15211 777 aa26.9■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.9■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 FBXO3Q9UK99 471 aa26.9■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 ADORA1P30542 326 aa26.89■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
VSX1-205ENST00000429762 USP26Q9BXU7 913 aa26.89■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 ATP5JP18859 108 aa26.88■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 TAF1P21675 1872 aa26.88■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 ZNF827Q17R98 1081 aa26.88■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 ADRA2BP18089 450 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 NFIXQ14938 502 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 EVI5LQ96CN4 794 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 NYXQ9GZU5 481 aa26.86■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 PLSCR1O15162 318 aa26.85■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 REC8O95072 547 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 GYS1P13807 737 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 SSFA2P28290 1259 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 ATP2B3Q16720 1220 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 XAGE2Q96GT9 111 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-205ENST00000429762 KIF2CQ99661 725 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms