RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 ITGB7P26010 798 aa6.9□□□□□ -1.3
RPS3AP9-201ENST00000417027 XP32Q5T750 250 aa6.9□□□□□ -1.3
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGFLR1Q9H665 355 aa6.9□□□□□ -1.3
RPS3AP9-201ENST00000417027 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.9□□□□□ -1.3
RPS3AP9-201ENST00000417027 INPP5BP32019 993 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 IDH3AP50213 366 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 COL26A1Q96A83 441 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 GSX2Q9BZM3 304 aa6.89□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 MICAL2O94851 1124 aa6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 APBA3O96018 575 aa6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARSDP51689 593 aa6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCINQ13939 588 aa6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.88□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 COX20Q5RI15 118 aa6.87□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 IFT43Q96FT9 208 aa6.87□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.87□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 NID1P14543 1247 aa6.86□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.86□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 NACC1Q96RE7 527 aa6.86□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.86□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.86□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 LILRB5O75023 590 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 NFKB1P19838 968 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 GATA4P43694 442 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRIK4Q16099 956 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 C16orf46Q6P387 395 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUDT8Q8WV74 236 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAGPAQ9UK23 515 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 OPLAHO14841 1288 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP3K6O95382 1288 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 PCSK7Q16549 785 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 TREML1Q86YW5 311 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RPS3AP9-201ENST00000417027 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAC1P63000 192 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC27Q2M243 656 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q8N3U1 123 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 EGFRP00533 1210 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP2B4P23634 1241 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFATQ9P243 1243 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLAIN2Q9P270 581 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 USP20Q9Y2K6 914 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 E9PSI1 815 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNFRSF10BO14763 440 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGSF3O75054 1194 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 SASH3O75995 380 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 RARAP10276 462 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLAURQ03405 335 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM35AQ86V20 835 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 A0A0A0MRY4 1105 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 XYLBO75191 536 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 CPB1P15086 417 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM26DQ5JW98 314 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 STIM2Q9P246 746 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 ELNP15502 786 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 SELPP16109 830 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPLD1P80108 840 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.77□□□□□ -1.33
RPS3AP9-201ENST00000417027 NRLP54845 237 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 613 ms