RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408953.3

ZBED8-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED8, Length 2,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-201ENST00000408953 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.63■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.63■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.63■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 NWD1Q149M9 1564 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 RESTQ13127 1097 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 H3BQV1 296 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CHGBP05060 677 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 SKILP12757 684 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 IFFO2Q5TF58 517 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 C14orf37Q86TY3 774 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 KIF18AQ8NI77 898 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 SUCLG2Q96I99 432 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.62■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 BTBD11A6QL63 1104 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 HIP1O00291 1037 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 FBXW7Q969H0 707 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 KAZALD1Q96I82 304 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 PTPRUQ92729 1446 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ABTB2Q8N961 1025 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 AGLP35573 1532 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 PPFIA3O75145 1194 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 PTPN14Q15678 1187 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 GTF3C6Q969F1 213 aa15.61■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 TEFQ10587 303 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 NPHP1O15259 732 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 TAF5LO75529 589 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 SLFN14P0C7P3 912 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CDC25BP30305 580 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 NBPF4Q96M43 638 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 SNRKQ9NRH2 765 aa15.6■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC69A6NI79 296 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 Q6ZUG5 572 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 TNRQ92752 1358 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 MED23Q9ULK4 1368 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 BECN2A8MW95 431 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 HOXB7P09629 217 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 KSR2Q6VAB6 950 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ALDH1L1O75891 902 aa15.58■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 SARM1Q6SZW1 724 aa15.58■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.58■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.58■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.58■□□□□ 0.09
ZBED8-201ENST00000408953 ELF2Q15723 593 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 NEK1Q96PY6 1258 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 COL15A1P39059 1388 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 PIK3C2AO00443 1686 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CCZ1BP86790 482 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CFAP45Q9UL16 551 aa15.58■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 GRM8O00222 908 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 SCRN1Q12765 414 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 STX1AQ16623 288 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CAVIN2O95810 425 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 KRT222Q8N1A0 295 aa15.56■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 ST7Q9NRC1 585 aa15.56■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 FGD1P98174 961 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 TERF2Q15554 542 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 USP28Q96RU2 1077 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 DIP2BQ9P265 1576 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 NEMFO60524 1076 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 CYP21A2P08686 494 aa15.55■□□□□ 0.08
ZBED8-201ENST00000408953 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms