RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.39■■□□□ 1.18
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CBX1-202ENST00000393408 COL15A1P39059 1388 aa22.38■■□□□ 1.17
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CBX1-202ENST00000393408 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.164e-13■■□□□ 13.1
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CBX1-202ENST00000393408 A0A087WZG4 1122 aa22.27■■□□□ 1.16
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CBX1-202ENST00000393408 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.27■■□□□ 1.16
CBX1-202ENST00000393408 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.27■■□□□ 1.16
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