RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384606.1

RNU6-658P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 658, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-658P, Length 106 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-658P-201ENST00000384606 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SEPT3Q9UH03 358 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 A6NJY4 79 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 CD33P20138 364 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ARHGAP4P98171 946 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 FGD1P98174 961 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ECM1Q16610 540 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 C16orf46Q6P387 395 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 NLRP8Q86W28 1048 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 CITED4Q96RK1 184 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 UNCXA6NJT0 531 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 NDUFB5O43674 189 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 IL2RAP01589 272 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ITGAEP38570 1179 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SMTNP53814 917 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 TNP2Q05952 138 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 TNS4Q8IZW8 715 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ABTB2Q8N961 1025 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 GIPC2Q8TF65 315 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 MYO19Q96H55 970 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 M0R082 166 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 CDK2AP1O14519 115 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SELPP16109 830 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC9A9Q8IVB4 645 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF417Q8TAU3 575 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 XAGE2Q96GT9 111 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 MDFIQ99750 246 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 ANO2Q9NQ90 1003 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 LGR5O75473 907 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 TLR1Q15399 786 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 STIM2Q9P246 746 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 HCN2Q9UL51 889 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-658P-201ENST00000384606 NID1P14543 1247 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 MPSTP25325 297 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 PDE3BQ13370 1112 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 MTMR3Q13615 1198 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 TEAD4Q15561 434 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 BRPF3Q9ULD4 1205 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 SERTM1A2A2V5 107 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 TREHO43280 583 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 BRD2P25440 801 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 SSTR4P31391 388 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC51AQ86UW1 340 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 EML1O00423 815 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 TNFRSF10BO14763 440 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 USP5P45974 858 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 CD97P48960 835 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 HIF1AQ16665 826 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 RTN1Q16799 776 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 COX20Q5RI15 118 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 TRAPPC3LQ5T215 181 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMC7Q7Z402 723 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 SYT9Q86SS6 491 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-658P-201ENST00000384606 FAM129BQ96TA1 746 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms