RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKL5O76039 1030 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMC1P11047 1609 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 HPS3Q969F9 1004 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MYL1P05976 194 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2C19P33261 490 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf46Q504U0 113 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ROCK1Q13464 1354 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 DYTNA2CJ06 578 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NEFHP12036 1026 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 RWDD2BP57060 319 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf34Q49A92 452 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TEKT1Q969V4 418 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GUL7 405 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 IMPDH2P12268 514 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 BECN1Q14457 450 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PKN1Q16512 942 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCF2Q9UG63 623 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NOS1P29475 1434 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 KIF5CO60282 957 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 KANK3Q6NY19 840 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 AFAP1Q8N556 730 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCC5O15440 1437 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 DAPK1P53355 1430 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRB3O60242 1522 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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RABGEF1-202ENST00000380828 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 CD248Q9HCU0 757 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX19P40855 299 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 TPPPO94811 219 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 MCM6Q14566 821 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 PLPP6Q8IY26 295 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAK2O60296 914 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD7Q92527 254 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.01□□□□□ -1.13
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRT38O76015 456 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 SMUG1Q53HV7 270 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 SOGA3Q5TF21 947 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 PSME1Q06323 249 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 PARP9Q8IXQ6 854 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf20Q8ND61 904 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 SH3GL3Q99963 347 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 CBFA2T2O43439 604 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF132P52740 706 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 GRIK3Q13003 919 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 BARGINQ6ZT62 677 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 NEK11Q8NG66 645 aa8□□□□□ -1.13
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM81BQ96LP2 452 aa8□□□□□ -1.13
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