RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 FOXO4P98177 505 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 CEP85Q6P2H3 762 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.91■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 CTSWP56202 376 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 NLRP3Q96P20 1036 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.89■■□□□ 1.58
RALGPS1-204ENST00000373436 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.89■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 GCC1Q96CN9 775 aa24.87■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 CSF1RP07333 972 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 PDE6BP35913 854 aa24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 CRY2Q49AN0 593 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.84■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 NUCB1Q02818 461 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 MTX1Q13505 466 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM161AQ3B820 660 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 GREM2Q9H772 168 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-204ENST00000373436 TAF1P21675 1872 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 HMMRO75330 724 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP8B2P98198 1209 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 DCTPP1Q9H773 170 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 SRGAP3O43295 1099 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 RTL9Q8NET4 1388 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 SRGNP10124 158 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 ITGA6P23229 1130 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 KLHL34Q8N239 644 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 PDE4AP27815 886 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 LNPKQ9C0E8 428 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 H0YIN7 160 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 CHRNA5P30532 468 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 SSH3Q8TE77 659 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 COL4A1P02462 1669 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 POLA2Q14181 598 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 NPR1P16066 1061 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 MASTLQ96GX5 879 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 SPEF2Q9C093 1822 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 LRP5O75197 1615 aa24.76■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 TGFB2P61812 414 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 CACNA1SQ13698 1873 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A0G2JLW4 131 aa24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 DPEP1P16444 411 aa24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 STYK1Q6J9G0 422 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 BACH2Q9BYV9 841 aa24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNA3P22001 575 aa24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 GRAPQ13588 217 aa24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.71■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 COPRSQ9NQ92 184 aa24.71■■□□□ 1.55
RALGPS1-204ENST00000373436 APBB1O00213 710 aa24.7■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 ALDH1B1P30837 517 aa24.7■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.7■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 SIL1Q9H173 461 aa24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 SLX4Q8IY92 1834 aa24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 CNKSR1Q969H4 720 aa24.69■■□□□ 1.54
RALGPS1-204ENST00000373436 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms