RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 TJP1Q07157 1748 aa27.13■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 SYNE4Q8N205 404 aa27.13■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 MRE11P49959 708 aa27.12■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.12■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.12■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.12■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 SLC27A2O14975 620 aa27.12■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 KCNB2Q92953 911 aa27.11■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.11■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.1■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.1■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.1■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 FAM89AQ96GI7 184 aa27.1■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 MED23Q9ULK4 1368 aa27.1■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 HIP1O00291 1037 aa27.09■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 ST3GAL1Q11201 340 aa27.09■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 NECAB1Q8N987 351 aa27.08■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.08■■□□□ 1.93
C9orf163-201ENST00000354376 ISCA1Q9BUE6 129 aa27.07■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 SNRKQ9NRH2 765 aa27.07■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 TAF5LO75529 589 aa27.07■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 HLFQ16534 295 aa27.07■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 TCIRG1Q13488 830 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 ME3Q16798 604 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF609O15014 1411 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 GPTP24298 496 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 VPS53Q5VIR6 699 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 HAUS7Q99871 368 aa27.06■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.05■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 GOLIM4O00461 696 aa27.04■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.04■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 EYA2O00167 538 aa27.04■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.04■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 SYT1P21579 422 aa27.03■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.02■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
C9orf163-201ENST00000354376 A0A1B0GUL7 405 aa27.01■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 GJB2P29033 226 aa27.01■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ITGB4P16144 1822 aa27.01■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 A0A0G2JS52 829 aa27.01■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.01■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ADAMTS2O95450 1211 aa27■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ADORA1P30542 326 aa27■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 PKNOX2Q96KN3 472 aa27■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 TCHHQ07283 1943 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 DISP2A7MBM2 1401 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 A0A0G2JLW4 131 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 STX6O43752 255 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 STARD3NLO95772 234 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 JCADQ9P266 1359 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 USP48Q86UV5 1035 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.98■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 EXOC5O00471 708 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 STK3Q13188 491 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 BCL9O00512 1426 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF445P59923 1031 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 SYCE3A1L190 88 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 RPS6KB1P23443 525 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 RNF20Q5VTR2 975 aa26.96■■□□□ 1.91
C9orf163-201ENST00000354376 CYP21A2P08686 494 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 PSMA5P28066 241 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 RBSNQ9H1K0 784 aa26.95■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.94■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 SCARF1Q14162 830 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 NLRP10Q86W26 655 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.93■■□□□ 1.9
C9orf163-201ENST00000354376 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms