RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352066.7

NUP62-201, Transcript of nucleoporin 62, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP62, Length 2,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62-201ENST00000352066 ZNF790Q6PG37 636 aa14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 JAK2O60674 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 CHGBP05060 677 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 KCNB2Q92953 911 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 PPFIA3O75145 1194 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 GCKRQ14397 625 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TRIM5Q9C035 493 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TFCP2Q12800 502 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 NEK1Q96PY6 1258 aa14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PXDNQ92626 1479 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 TAF5LO75529 589 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.58□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PTGS1P23219 599 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 Q6ZUG5 572 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 KIF3AQ9Y496 699 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 KRT32Q14532 448 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PDIA6Q15084 440 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 BRF1Q92994 677 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.57□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 A0A087WZG4 1122 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 NR1I2O75469 434 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 TPM3P06753 285 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 USP16Q9Y5T5 823 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 TNNI3KQ59H18 835 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 CBX8Q9HC52 389 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.56□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 ZNF165P49910 485 aa14.55□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.55□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.55□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.55□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 LTN1O94822 1766 aa14.55□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 ELP1O95163 1332 aa14.54□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.54□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 UTYO14607 1347 aa14.54□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 ATP5JP18859 108 aa14.54□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 GTF3C6Q969F1 213 aa14.54□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 CYP21A2P08686 494 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 FBXW7Q969H0 707 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 LRMPQ12912 555 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 CFAP45Q9UL16 551 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.53□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 MED23Q9ULK4 1368 aa14.52□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 GOLIM4O00461 696 aa14.52□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.52□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 PGBD1Q96JS3 809 aa14.52□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
NUP62-201ENST00000352066 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 GUCY1B3Q02153 619 aa14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 COPRSQ9NQ92 184 aa14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 CHST3Q7LGC8 479 aa14.52□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 NCAPD2Q15021 1401 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 NFAT5O94916 1531 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 TIMM10P62072 90 aa14.51□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NUP62-201ENST00000352066 APOBRQ0VD83 1088 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms