RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 SUSD4Q5VX71 490 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 WBP1LQ9NX94 342 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 PCNTO95613 3336 aa20.31■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.3■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 KIF16BQ96L93 1317 aa20.29■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 PARP10Q53GL7 1025 aa20.29■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 NECTIN2Q92692 538 aa20.29■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.29■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 COL4A5P29400 1685 aa20.29■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 NTSR2O95665 410 aa20.28■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 NIM1KQ8IY84 436 aa20.28■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 NLRP3Q96P20 1036 aa20.28■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 BCAR3O75815 825 aa20.27■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
IFT20-201ENST00000322326 EPS15P42566 896 aa20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 SCNN1DP51172 638 aa20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 LBX1P52954 281 aa20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 LTBP1Q14766 1721 aa20.26■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 PPIP5K2O43314 1243 aa20.25■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 VPS33BQ9H267 617 aa20.25■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 SLC4A2P04920 1241 aa20.24■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.24■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 HYPKQ9NX55 129 aa20.24■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 ECE1P42892 770 aa20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.23■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.22■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 AOC3Q16853 763 aa20.22■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.22■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.21■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.21■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 ABCC4O15439 1325 aa20.21■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 PTPRCP08575 1304 aa20.21■□□□□ 0.83
IFT20-201ENST00000322326 PDIA6Q15084 440 aa20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 SLC51AQ86UW1 340 aa20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 CAPNS2Q96L46 248 aa20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 BBOX1O75936 387 aa20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 MS4A1P11836 297 aa20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 FLIIQ13045 1269 aa20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.19■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 TRAF5O00463 557 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 ANXA1P04083 346 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 CXCL9Q07325 125 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 GRM1Q13255 1194 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 PROSER3Q2NL68 480 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 SP8Q8IXZ3 490 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.18■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 NEFLP07196 543 aa20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 CST9Q5W186 159 aa20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 G2E3Q7L622 706 aa20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 MPNDQ8N594 471 aa20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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IFT20-201ENST00000322326 PLIN1O60240 522 aa20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 COPS6Q7L5N1 327 aa20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 ABHD8Q96I13 439 aa20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.16■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
IFT20-201ENST00000322326 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.15■□□□□ 0.82
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