RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295083.7

PQLC3-201, Transcript of PQ loop repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PQLC3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC3-201ENST00000295083 GREM2Q9H772 168 aa30.91■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 PDE6BP35913 854 aa30.91■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 CRY2Q49AN0 593 aa30.91■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 CEP85Q6P2H3 762 aa30.91■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.91■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 FAM161AQ3B820 660 aa30.9■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 KLHL34Q8N239 644 aa30.9■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 KIF13BQ9NQT8 1826 aa30.9■■■□□ 2.54
PQLC3-201ENST00000295083 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa30.89■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 CHRNA5P30532 468 aa30.89■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.89■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.89■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.88■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 UTRNP46939 3433 aa30.88■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 SRGNP10124 158 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 MTX1Q13505 466 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 TAF1P21675 1872 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 SRGAP3O43295 1099 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 ATP8B2P98198 1209 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 AAMPQ13685 434 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 C2CD5Q86YS7 1000 aa30.87■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 CD2APQ9Y5K6 639 aa30.86■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 ITGA6P23229 1130 aa30.85■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 A0A0G2JLW4 131 aa30.84■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 H0YIN7 160 aa30.84■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 COL4A1P02462 1669 aa30.84■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.83■■■□□ 2.53
PQLC3-201ENST00000295083 DPEP1P16444 411 aa30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 RTL9Q8NET4 1388 aa30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 KCNA3P22001 575 aa30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 NPR1P16066 1061 aa30.81■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 TGFB2P61812 414 aa30.81■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 SSH3Q8TE77 659 aa30.81■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 MASTLQ96GX5 879 aa30.81■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa30.81■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 POLA2Q14181 598 aa30.8■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.8■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP30.8■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.8■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.78■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.77■■■□□ 2.52
PQLC3-201ENST00000295083 STYK1Q6J9G0 422 aa30.76■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 GRAPQ13588 217 aa30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 SLC51AQ86UW1 340 aa30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 SYT17Q9BSW7 474 aa30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 WWC3Q9ULE0 1092 aa30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.74■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 LRP5O75197 1615 aa30.74■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 TAF7LQ5H9L4 462 aa30.74■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 SIL1Q9H173 461 aa30.74■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 COPRSQ9NQ92 184 aa30.74■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 HMMRO75330 724 aa30.73■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 ALDH1B1P30837 517 aa30.73■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.73■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 IGHDP01880 384 aa30.73■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.72■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 CACNA1SQ13698 1873 aa30.72■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 SPEF2Q9C093 1822 aa30.72■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 LRRC24Q50LG9 513 aa30.71■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.71■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 SLX4Q8IY92 1834 aa30.71■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 CNKSR1Q969H4 720 aa30.7■■■□□ 2.51
PQLC3-201ENST00000295083 SURF6O75683 361 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.7■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 PIM2Q9P1W9 311 aa30.7■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 BBOX1O75936 387 aa30.69■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 TTLL6Q8N841 843 aa30.69■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa30.69■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 OLFM4Q6UX06 510 aa30.68■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 ATG9AQ7Z3C6 839 aa30.68■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 EYA2O00167 538 aa30.67■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.67■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.67■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
PQLC3-201ENST00000295083 DCTPP1Q9H773 170 aa30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms