RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 RNF20Q5VTR2 975 aa23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 PSMA5P28066 241 aa23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 USP48Q86UV5 1035 aa23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.03■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 JCADQ9P266 1359 aa23.03■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 GJB2P29033 226 aa23.03■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 EVA1CP58658 441 aa23.03■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 ME3Q16798 604 aa23.03■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 ST3GAL1Q11201 340 aa23.02■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP21-201ENST00000289865 TNS2Q63HR2 1409 aa23.02■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 DTNBO60941 627 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TAF5LO75529 589 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 HAUS7Q99871 368 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 F13A1P00488 732 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 NECAB1Q8N987 351 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 RFX7Q2KHR2 1363 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 CCDC191Q8NCU4 936 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 HMG20BQ9P0W2 317 aa23■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ZNF609O15014 1411 aa22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ESPNB1AK53 854 aa22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 CHGBP05060 677 aa22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 RPS6KB1P23443 525 aa22.98■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.98■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.98■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.97■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 CLCN1P35523 988 aa22.97■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.97■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 MTMR6Q9Y217 621 aa22.97■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.97■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ANKRD1Q15327 319 aa22.96■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.96■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP21-201ENST00000289865 TIMM10P62072 90 aa22.95■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.95■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 LRRC24Q50LG9 513 aa22.95■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.94■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 EYA2O00167 538 aa22.94■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 GPR108Q9NPR9 543 aa22.94■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 FIBPO43427 364 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 KRT32Q14532 448 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 GOLIM4O00461 696 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 TSPY26PQ9H489 355 aa22.92■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 PALLDQ8WX93 1383 aa22.92■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 PHF14O94880 888 aa22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 TCIRG1Q13488 830 aa22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 UBE2HP62256 183 aa22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 CIAO1O76071 339 aa22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 PIGBQ92521 554 aa22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 ATG3Q9NT62 314 aa22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 STK3Q13188 491 aa22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 RNF214Q8ND24 703 aa22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 NEK1Q96PY6 1258 aa22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GUL7 405 aa22.89■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.89■■□□□ 1.26
USP21-201ENST00000289865 CYP21A2P08686 494 aa22.89■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.89■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.89■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 BTG4Q9NY30 223 aa22.89■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.88■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.88■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.87■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms