RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 COPS6Q7L5N1 327 aa33.33■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 MYD88Q99836 296 aa33.33■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 USP25Q9UHP3 1055 aa33.33■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 ELP1O95163 1332 aa33.33■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 MYL6BP14649 208 aa33.33■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 PHKG2P15735 406 aa33.33■■■□□ 2.93
UBP1-201ENST00000283628 KRT85P78386 507 aa33.32■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 ATP5JP18859 108 aa33.32■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 KRT32Q14532 448 aa33.31■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa33.3■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa33.3■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 ABCA3Q99758 1704 aa33.3■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa33.3■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 TAF5LO75529 589 aa33.29■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 GIMAP6Q6P9H5 292 aa33.28■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.28■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
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UBP1-201ENST00000283628 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa33.27■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 SASS6Q6UVJ0 657 aa33.26■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 CDC37L1Q7L3B6 337 aa33.26■■■□□ 2.92
UBP1-201ENST00000283628 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa33.26■■■□□ 2.91
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UBP1-201ENST00000283628 PDCL3Q9H2J4 239 aa33.25■■■□□ 2.91
UBP1-201ENST00000283628 CCDC192P0DO97 292 aa33.25■■■□□ 2.91
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UBP1-201ENST00000283628 DCAF5Q96JK2 942 aa33.24■■■□□ 2.91
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UBP1-201ENST00000283628 UQCRHLA0A096LP55 91 aa33.23■■■□□ 2.91
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UBP1-201ENST00000283628 PIBF1Q8WXW3 757 aa33.23■■■□□ 2.91
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UBP1-201ENST00000283628 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.22■■■□□ 2.91
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF609O15014 1411 aa33.17■■■□□ 2.9
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UBP1-201ENST00000283628 CASP7P55210 303 aa33.14■■■□□ 2.9
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UBP1-201ENST00000283628 FAM173BQ6P4H8 233 aa33.11■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa33.11■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 PALLDQ8WX93 1383 aa33.11■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
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UBP1-201ENST00000283628 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
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