RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 CACNA1SQ13698 1873 aa19.67■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 FAM161AQ3B820 660 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 KLHL34Q8N239 644 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 TTLL11Q8NHH1 800 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 NLRP3Q96P20 1036 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.66■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 CEP85Q6P2H3 762 aa19.65■□□□□ 0.74
CCL25-201ENST00000253451 CSF1RP07333 972 aa19.64■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 GREM2Q9H772 168 aa19.64■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.64■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 RTL9Q8NET4 1388 aa19.63■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 CHRNA5P30532 468 aa19.63■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 PDE6BP35913 854 aa19.63■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 CRY2Q49AN0 593 aa19.63■□□□□ 0.73
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CCL25-201ENST00000253451 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.63■□□□□ 0.73
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CCL25-201ENST00000253451 MTX1Q13505 466 aa19.62■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 AAMPQ13685 434 aa19.61■□□□□ 0.73
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CCL25-201ENST00000253451 H0YIN7 160 aa19.59■□□□□ 0.73
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CCL25-201ENST00000253451 ATP8B2P98198 1209 aa19.59■□□□□ 0.73
CCL25-201ENST00000253451 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.59■□□□□ 0.73
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CCL25-201ENST00000253451 POLA2Q14181 598 aa19.58■□□□□ 0.72
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CCL25-201ENST00000253451 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19.57■□□□□ 0.72
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CCL25-201ENST00000253451 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.57■□□□□ 0.72
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CCL25-201ENST00000253451 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
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CCL25-201ENST00000253451 SLC51AQ86UW1 340 aa19.56■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 TGFB2P61812 414 aa19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 GRAPQ13588 217 aa19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 CRAMP1Q96RY5 1269 aa19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 HMMRO75330 724 aa19.54■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.54■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 SIL1Q9H173 461 aa19.54■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.54■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 RPS8P62241 208 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 COPRSQ9NQ92 184 aa19.52■□□□□ 0.72
CCL25-201ENST00000253451 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 LRRC24Q50LG9 513 aa19.51■□□□□ 0.71
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CCL25-201ENST00000253451 CNKSR1Q969H4 720 aa19.51■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 SYT17Q9BSW7 474 aa19.51■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.51■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 SURF6O75683 361 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 IGHDP01880 384 aa19.5■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 ALDH1B1P30837 517 aa19.5■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 MPHOSPH8Q99549 860 aa19.5■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 LTBP1Q14766 1721 aa19.5■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 EYA2O00167 538 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 TTLL6Q8N841 843 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 PIM2Q9P1W9 311 aa19.49■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 OLFM4Q6UX06 510 aa19.48■□□□□ 0.71
CCL25-201ENST00000253451 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
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