RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 SSFA2P28290 1259 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 TIMM10P62072 90 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 ATP6V1AP38606 617 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 SIK1P57059 783 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 NECTIN1Q15223 517 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 MAP4K1Q92918 833 aa22.3■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.3■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 NUP98P52948 1817 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 MED23Q9ULK4 1368 aa22.3■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.3■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.28■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 ITPK1Q13572 414 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.28■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 C8orf37Q96NL8 207 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.28■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 A0A1B0GUL7 405 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 KCNQ2O43526 872 aa22.27■■□□□ 1.16
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HOXC11-201ENST00000243082 NGLY1Q96IV0 654 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC11-201ENST00000243082 PKP1Q13835 747 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 PALLDQ8WX93 1383 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 CTSWP56202 376 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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HOXC11-201ENST00000243082 CHGBP05060 677 aa22.24■■□□□ 1.15
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HOXC11-201ENST00000243082 ITGA6P23229 1130 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 TAF5LO75529 589 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 AK2P54819 239 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 PDE8AO60658 829 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 CPA1P15085 419 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 SLC27A2O14975 620 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 CAMTA2O94983 1202 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 KCNJ4P48050 445 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 GOLIM4O00461 696 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 SUSD4Q5VX71 490 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 RUFY3Q7L099 469 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC11-201ENST00000243082 MYH3P11055 1940 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 ADORA1P30542 326 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 TICAM2Q86XR7 235 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 XAGE2Q96GT9 111 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 VPS53Q5VIR6 699 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.19■■□□□ 1.14
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