RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC158Q5M9N0 1113 aa12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 STAP2Q9UGK3 403 aa12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 MCM4P33991 863 aa12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 MYH3P11055 1940 aa12.73□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 ADCY9O60503 1353 aa12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 POLA2Q14181 598 aa12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 LMBR1LQ6UX01 489 aa12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 DDB1Q16531 1140 aa12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP2Q9Y2D5 859 aa12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC191Q8NCU4 936 aa12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 COL15A1P39059 1388 aa12.71□□□□□ -0.37
PRRX1-201ENST00000239461 A1BGP04217 495 aa12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CNNM1Q9NRU3 951 aa12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 BAG6P46379 1132 aa12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 UNC5CLQ8IV45 518 aa12.71□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TTC39AQ5SRH9 613 aa12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 AK7Q96M32 723 aa12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TRAK2O60296 914 aa12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 MTX1Q13505 466 aa12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.7□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 UBR3Q6ZT12 1888 aa12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 IL15P40933 162 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM34Q9BYJ4 488 aa12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ZPR1O75312 459 aa12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 RXRBP28702 533 aa12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 KIF3AQ9Y496 699 aa12.69□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 LRP5O75197 1615 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CLSTN1O94985 981 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 POLD1P28340 1107 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 GPR162Q16538 588 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 FAM182BQ5T319 152 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 UTYO14607 1347 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 KRT32Q14532 448 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD1Q15327 319 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 WASHC4Q2M389 1173 aa12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 APBA3O96018 575 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 GPTP24298 496 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF652Q9Y2D9 606 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 MCTP1Q6DN14 999 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJC10Q8IXB1 793 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ARAP2Q8WZ64 1704 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 HSPA1LP34931 641 aa12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 METTL24Q5JXM2 366 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TFCP2Q12800 502 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 RAD50Q92878 1312 aa12.66□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 MPHOSPH8Q99549 860 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 SGSM2O43147 1006 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 IGKV5-2P06315 115 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TTLL7Q6ZT98 887 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 COPRSQ9NQ92 184 aa12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
PRRX1-201ENST00000239461 TCIRG1Q13488 830 aa12.65□□□□□ -0.39
PRRX1-201ENST00000239461 TNNI3KQ59H18 835 aa12.65□□□□□ -0.39
PRRX1-201ENST00000239461 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa12.65□□□□□ -0.39
PRRX1-201ENST00000239461 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.65□□□□□ -0.39
PRRX1-201ENST00000239461 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.65□□□□□ -0.39
PRRX1-201ENST00000239461 ATP6V1AP38606 617 aa12.64□□□□□ -0.39
PRRX1-201ENST00000239461 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms