RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 CASP7P55210 303 aa21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 ANAPC15P60006 121 aa21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 HSPA4P34932 840 aa21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 PKP1Q13835 747 aa21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 RAD50Q92878 1312 aa21.96■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.96■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.96■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 COL15A1P39059 1388 aa21.96■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 PLSCR1O15162 318 aa21.95■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 GBP4Q96PP9 640 aa21.95■■□□□ 1.11
USP18-201ENST00000215794 IL17RAQ96F46 866 aa21.94■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 TMX3Q96JJ7 454 aa21.94■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 AK7Q96M32 723 aa21.94■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 COPRSQ9NQ92 184 aa21.94■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.94■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.94■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.93■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 GPTP24298 496 aa21.93■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 ZNF827Q17R98 1081 aa21.92■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 EVI5LQ96CN4 794 aa21.92■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.92■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 H7C1W4 665 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 TFCP2Q12800 502 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 RASEFQ8IZ41 740 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 RPS6KA4O75676 772 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 FOXO4P98177 505 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 PTH1RQ03431 593 aa21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 CAMTA2O94983 1202 aa21.9■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.9■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.9■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 FAM227BQ96M60 508 aa21.89■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.89■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 NUP98P52948 1817 aa21.89■■□□□ 1.1
USP18-201ENST00000215794 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 MCM2P49736 904 aa21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 NUCB2P80303 420 aa21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 TNNI3KQ59H18 835 aa21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.89■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 FAM177BA6PVY3 158 aa21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.88■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 C4AP0C0L4 1744 aa21.87■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 TCIRG1Q13488 830 aa21.87■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.87■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 CUL4AQ13619 759 aa21.86■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.86■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 FSD1Q9BTV5 496 aa21.86■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.86■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.86■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 SYNE4Q8N205 404 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 A0A0D9SFI3 127 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 BAG6P46379 1132 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.85■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 BCORQ6W2J9 1755 aa21.84■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 CPA1P15085 419 aa21.84■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.84■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 RFC4P35249 363 aa21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 AKT1S1Q96B36 256 aa21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.83■■□□□ 1.09
USP18-201ENST00000215794 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
USP18-201ENST00000215794 TTC14Q96N46 770 aa21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms