RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 H7C1W4 665 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 NBPF26B4DH59 902 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 NBPF14Q5TI25 921 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 NBPF15Q8N660 670 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 NECAB1Q8N987 351 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 HAUS7Q99871 368 aa20.68■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.67■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 RNF214Q8ND24 703 aa20.67■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 FOXO4P98177 505 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 TCHHQ07283 1943 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 KRT32Q14532 448 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 UVSSAQ2YD98 709 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.66■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 FIBPO43427 364 aa20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 PDCP20941 246 aa20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 MCM5P33992 734 aa20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 TICAM2Q86XR7 235 aa20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CLDN11-201ENST00000064724 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 GPR108Q9NPR9 543 aa20.63■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.63■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF609O15014 1411 aa20.63■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.63■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 OFD1O75665 1012 aa20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 BRINP3Q76B58 766 aa20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.62■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.61■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 DTNBO60941 627 aa20.61■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.61■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 NEK1Q96PY6 1258 aa20.61■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.6■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.6■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.6■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 PALLDQ8WX93 1383 aa20.6■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 ELP1O95163 1332 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 ATG3Q9NT62 314 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.59■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 A1BGP04217 495 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 KRT85P78386 507 aa20.58■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CLDN11-201ENST00000064724 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 CYP21A2P08686 494 aa20.58■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.58■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 TNS2Q63HR2 1409 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 CHGBP05060 677 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 GTF3C6Q969F1 213 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 EYA2O00167 538 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 CIAO1O76071 339 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 TTC6Q86TZ1 520 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 IL2RBP14784 551 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.56■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 PAPPAQ13219 1627 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.55■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 TJP1Q07157 1748 aa20.54■□□□□ 0.88
CLDN11-201ENST00000064724 TIMM10P62072 90 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms