RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa29.09■■■□□ 2.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trpm7Q923J1 1863 aa29.09■■■□□ 2.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zap70P43404 618 aa29.08■■■□□ 2.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa29.08■■■□□ 2.25
Nelfe-202ENSMUST00000165953 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tom1l2Q5SRX1 507 aa29.07■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Skor1Q8BX46 964 aa29.07■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plekhg6Q8R0J1 787 aa29.07■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Bend3Q6PAL0 825 aa29.06■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 DaglaQ6WQJ1 1044 aa29.06■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa29.06■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa29.05■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa29.05■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Best3Q6H1V1 669 aa29.05■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CpvlQ9D3S9 478 aa29.05■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ly6iQ9WU67 134 aa29.05■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa29.04■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Psmd1Q3TXS7 953 aa29.03■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Itga6Q61739 1091 aa29.02■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 VwdeQ6DFV8 926 aa29.02■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Podxl2Q8CAE9 603 aa29.02■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NinQ61043 2035 aa29.02■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Glis3Q6XP49 780 aa29.01■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc93Q7TQK5 629 aa29.01■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Klf15Q9EPW2 415 aa29.01■■■□□ 2.24
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pappa2E9PZ87 1789 aa29■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NynrinQ5DTZ0 1840 aa29■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Celf1P28659 486 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc39a11Q8BWY7 342 aa29■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dpp7Q9ET22 506 aa28.99■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cdca7Q9D0M2 382 aa28.98■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Heg1E9Q7X6 1337 aa28.97■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NexnQ7TPW1 607 aa28.97■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slfn1Q9Z0I7 337 aa28.97■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 1700029H14RikE9PY36 240 aa28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Grm8P47743 908 aa28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ric3Q8BPM6 367 aa28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Smc4Q8CG47 1286 aa28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Socs7Q8VHQ2 579 aa28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tnip1Q9WUU8 647 aa28.96■■■□□ 2.23
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gnat3Q3V3I2 354 aa28.95■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ecm29Q6PDI5 1840 aa28.94■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col1a1P11087 1453 aa28.94■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ube4aE9Q735 1028 aa28.94■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plagl1Q9JLQ4 704 aa28.94■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Bend4P86174 541 aa28.93■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ell2Q3UKU1 639 aa28.93■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 IntuQ059U7 942 aa28.92■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Scaf8Q6DID3 1268 aa28.92■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa28.92■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Il15P48346 162 aa28.91■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 GmpsQ3THK7 693 aa28.91■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa28.91■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa28.9■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc14a2Q8R4T9 930 aa28.9■■■□□ 2.22
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Hoxd11P23813 323 aa28.88■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nlgn2Q69ZK9 836 aa28.88■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa28.88■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 GpkowQ56A08 488 aa28.88■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ofd1Q80Z25 1017 aa28.88■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Psmd14O35593 310 aa28.87■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc38a10Q5I012 1090 aa28.87■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ptrh1Q8BW00 204 aa28.87■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa28.87■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf496Q5SXI5 585 aa28.86■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kcnq5Q9JK45 933 aa28.86■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sytl4Q9R0Q1 673 aa28.86■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Q3UPC7 1272 aa28.85■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Angel2Q8K1C0 544 aa28.84■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 VegfbP49766 207 aa28.82■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Jarid2Q62315 1234 aa28.82■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CbarpQ66L44 698 aa28.82■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmem143Q8VD26 458 aa28.82■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Phrf1A6H619 1682 aa28.81■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AaasP58742 546 aa28.81■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ppp1r1bQ60829 194 aa28.81■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf330Q922H9 316 aa28.81■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Bin2D3Z6Q9 489 aa28.8■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Magea8O89012 320 aa28.8■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NyxP83503 476 aa28.8■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 InsrrQ9WTL4 1300 aa28.79■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Llgl2Q3TJ91 1027 aa28.79■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf219Q6IQX8 726 aa28.79■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa28.79■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Terf1P70371 421 aa28.78■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Micall1Q8BGT6 870 aa28.78■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmem67Q8BR76 992 aa28.78■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Psme4Q5SSW2 1843 aa28.78■■■□□ 2.2
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rps12P63323 132 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.5 ms