RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Brpf1B2RRD7 1212 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cfap44E9Q5M6 1843 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Magea1O89006 320 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Magea5O89009 320 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tgfb2P27090 414 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Atp8a2P98200 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Aldh8a1Q8BH00 487 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dydc2Q9D3X8 139 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Naa16Q9DBB4 864 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Magea2Q9R2A2 320 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Map3k15A2AQW0 1331 aa14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zkscan8Q8BSL0 588 aa14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CpvlQ9D3S9 478 aa14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Heg1E9Q7X6 1337 aa14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dok7Q18PE0 504 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nup188Q6ZQH8 1759 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Magea6O89010 325 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plbd2Q3TCN2 594 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Magea3Q6T340 320 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tmem143Q8VD26 458 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Usp21Q9QZL6 566 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Col3a1P08121 1464 aa14.62□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Neurod6P48986 337 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rad23bP54728 416 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znf496Q5SXI5 585 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 HlfQ8BW74 295 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ciapin1Q8WTY4 309 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 UvssaQ9D479 717 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sh3bp5Q9Z131 463 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plekhf1Q3TB82 279 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cgnl1Q6AW69 1298 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hirip3Q8BLH7 601 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gcc1Q9D4H2 778 aa14.61□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc4a3P16283 1227 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ubxn2bQ0KL01 331 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Taf1dQ9D4V4 322 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 EgfrQ01279 1210 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ccdc27Q3V036 639 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NfkbibQ60778 359 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa14.6□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CenpbP27790 599 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Celf1P28659 486 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pcsk7Q61139 770 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cetn4Q8K4K1 168 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fbxo3Q9DC63 480 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pde8bE9Q4S1 865 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ccdc146E9Q9F7 977 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NfixP70257 488 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 IntuQ059U7 942 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gsdma2Q32M21 443 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Atp2b4Q6Q477 1205 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam102bQ8BQS4 339 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 WaslQ91YD9 501 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dbr1Q923B1 550 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zfp831A2ADM8 1628 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Il15P48346 162 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Chmp5Q9D7S9 219 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 EvplQ9D952 2035 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Scn11aQ9R053 1765 aa14.59□□□□□ -0.07
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Timm10P62073 90 aa14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Phrf1A6H619 1682 aa14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 GabrdP22933 449 aa14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cyp2ab1S4R196 498 aa14.58□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc26a8Q8R0C3 999 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Supt16hQ920B9 1047 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slfn1Q9Z0I7 337 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nphp3Q7TNH6 1325 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mcm2P97310 904 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Atp2b3Q0VF55 1220 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Camkk2Q8C078 588 aa14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 DbnlQ62418 436 aa14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 B4galnt3Q6L8S8 986 aa14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bcar3Q9QZK2 820 aa14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Speer4dL7N216 212 aa14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr247E9PVJ7 320 aa14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pnmal2G3X9N3 661 aa14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr819K7N727 320 aa14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bend4P86174 541 aa14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Asap2Q7SIG6 958 aa14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cd248Q91V98 765 aa14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Osbpl5Q9ER64 874 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 347.1 ms