RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp8a2P98200 1148 aa22.22■■□□□ 1.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 RestQ8VIG1 1082 aa22.22■■□□□ 1.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf609Q8BZ47 1413 aa22.22■■□□□ 1.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DbnlQ62418 436 aa22.21■■□□□ 1.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sned1Q70E20 1403 aa22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rabep1O35551 862 aa22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gsdma2Q32M21 443 aa22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Taf5lQ91WQ5 589 aa22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phrf1A6H619 1682 aa22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q9D2X8 372 aa22.19■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nphp3Q7TNH6 1325 aa22.18■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col3a1P08121 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Msl1Q6PDM1 616 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zkscan8Q8BSL0 588 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CpzQ8R4V4 654 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 StrcQ8VIM6 1809 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 EappQ5BU09 281 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mctp2Q5RJH2 878 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plekho1Q9JIY0 408 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gja10Q9WUS4 505 aa22.17■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif23E9Q5G3 953 aa22.16■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 OscarQ8VBT3 265 aa22.16■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxo3Q9DC63 480 aa22.16■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plbd2Q3TCN2 594 aa22.15■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 1810065E05RikQ5NC41 235 aa22.15■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif2cQ922S8 721 aa22.15■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bin2D3Z6Q9 489 aa22.15■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pde3bQ61409 1100 aa22.15■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Unc5clQ6R653 518 aa22.15■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa22.14■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myo3bQ1EG27 1305 aa22.14■■□□□ 1.14
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prdm11A2AGX3 565 aa22.14■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eva1cP58659 440 aa22.14■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Timm10P62073 90 aa22.14■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 VeztQ3ZK22 780 aa22.14■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Brf1Q8CFK2 676 aa22.14■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp6r3Q922D4 844 aa22.14■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ube4aE9Q735 1028 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 1700029H14RikE9PY36 240 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aknad1E9Q8N6 675 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slurp2P0DP59 97 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CalcaP70160 136 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp2b3Q0VF55 1220 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zbtb45Q52KG4 520 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem266Q8BZB3 538 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rhot2Q8JZN7 620 aa22.13■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ambra1A2AH22 1300 aa22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plekhf1Q3TB82 279 aa22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf692Q3U381 531 aa22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Asap2Q7SIG6 958 aa22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 St5Q924W7 1134 aa22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm7347D3YYI9 267 aa22.11■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pde8bE9Q4S1 865 aa22.11■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sptbn5F6UCX4 1208 aa22.11■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Speer4aF8VPX6 267 aa22.11■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mre11Q61216 706 aa22.11■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prune1Q8BIW1 454 aa22.11■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc39a11Q8BWY7 342 aa22.1■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stk3Q9JI10 497 aa22.1■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sh3bp5Q9Z131 463 aa22.1■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdhd1P59328 1117 aa22.09■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Strip1Q8C079 837 aa22.09■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa22.09■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TsksO54887 585 aa22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc4a1P04919 929 aa22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem143Q8VD26 458 aa22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnq5Q9JK45 933 aa22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col4a5Q63ZW6 1691 aa22.08■■□□□ 1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 EspnlQ3UYR4 1005 aa22.08■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ift57Q8BXG3 429 aa22.08■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krt25Q8VCW2 446 aa22.08■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nup188Q6ZQH8 1759 aa22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Heg1E9Q7X6 1337 aa22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col23a1Q8K4G2 532 aa22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adarb2Q9JI20 745 aa22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lgr5Q9Z1P4 907 aa22.07■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Speer4dL7N216 212 aa22.06■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GabrdP22933 449 aa22.06■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vps54Q5SPW0 977 aa22.06■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Myh7Q91Z83 1935 aa22.06■■□□□ 1.12
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