RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R43	P59537	309 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACTC1	P68032	377 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACTA1	P68133	377 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PON3	Q15166	354 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FAM209A	Q5JX71	171 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRIL	Q7L0X0	811 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RELT	Q969Z4	430 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR14A2	Q96R54	314 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SLC38A3	Q99624	504 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ABCG5	Q9H222	651 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JK05	382 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PPC4	97 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR6C68	A6NDL8	312 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HPGD	P15428	266 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB1	P43366	347 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PITPNB	P48739	271 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NRG3	P56975	720 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF141	Q15928	474 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CBLN3	Q6UW01	205 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RFT1	Q96AA3	541 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TSSK2	Q96PF2	358 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	COPS3	Q9UNS2	423 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP54	Q96N23	3096 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LRP4	O75096	1905 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WUJ7	227 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FZD7	O75084	574 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GPR176	Q14439	515 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MED25	Q71SY5	747 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PXK	Q7Z7A4	578 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MCUB	Q9NWR8	336 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SDC3	O75056	442 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SC5D	O75845	299 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PROS1	P07225	676 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	EDNRA	P25101	427 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CCR5	P51681	352 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GPR143	P51810	404 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	POU4F2	Q12837	409 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RIN1	Q13671	783 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CDK10	Q15131	360 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CD226	Q15762	336 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf49	Q96BT1	292 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MPDZ	O75970	2070 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OIP5	O43482	229 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CD3G	P09693	182 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ARSB	P15848	533 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ATF1	P18846	271 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	AQP2	P41181	271 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CAPZB	P47756	277 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN20	P56880	219 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SKP1	P63208	163 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SIRPA	P78324	504 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		Q5BKY6	102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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