RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PLAC1Q9HBJ0 212 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa19.17■□□□□ 0.66
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PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf67Q0P5P2 114 aa19.17■□□□□ 0.66
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PTPRJ-208ENST00000615445 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRJ-208ENST00000615445 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRJ-208ENST00000615445 BSGP35613 385 aa19.15■□□□□ 0.66
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