RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	EXT1	Q16394	746 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NIPAL3	Q6P499	406 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TXNDC15	Q96J42	360 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GPR78	Q96P69	363 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NELFA	Q9H3P2	528 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NGB	Q9NPG2	151 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GPRIN2	O60269	458 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CRHBP	P24387	322 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	AGTR1	P30556	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	C1orf198	Q9H425	327 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NUP205	Q92621	2012 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151		H3BMQ9	156 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CCL11	P51671	97 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FGL1	Q08830	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PIGC	Q92535	297 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	COG8	Q96MW5	612 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151		H7C1C5	153 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CD34	P28906	385 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ATP1B3	P54709	279 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LCN6	P62502	163 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	KCNAB1	Q14722	419 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	P2RY14	Q15391	338 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GGH	Q92820	318 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	METTL15	A6NJ78	407 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GPR171	O14626	319 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LYRM1	O43325	122 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SCGB2A1	O75556	95 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ST6GAL1	P15907	406 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PXK	Q7Z7A4	578 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NDNF	Q8TB73	568 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ASIC5	Q9NY37	505 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MLX	Q9UH92	298 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM72	A0PK05	275 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CTGF	P29279	349 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MOK	Q9UQ07	419 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CD40LG	P29965	261 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LSAMP	Q13449	338 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	XKR7	Q5GH72	579 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FAM57B	Q71RH2	274 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SLC15A4	Q8N697	577 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	IFI44	Q8TCB0	444 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FAM210A	Q96ND0	272 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ASB4	Q9Y574	426 aa		12.77	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	IDS	B3KWA1	339 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	SERPINE2	P07093	398 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	CARD18	P57730	90 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	CMIP	Q8IY22	773 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	ATP6V1G1	O75348	118 aa		12.77	□□□□□ -0.37
RAB18-208	ENST00000611151	GABRR1	P24046	479 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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