RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SPIB	Q01892	262 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MTX3	Q5HYI7	312 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FGD3	Q5JSP0	725 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	NAXE	Q8NCW5	288 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	OR52J3	Q8NH60	311 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PFN4	Q8NHR9	129 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ABHD3	Q8WU67	409 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SLC38A4	Q969I6	547 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TAAR8	Q969N4	342 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	C7orf34	Q96L11	122 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0G2JNJ9	132 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	DHRS12	A0PJE2	317 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	LIPT2	A6NK58	231 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PRSS23	O95084	383 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	AKR7A3	O95154	331 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PMS2P2	O95744	297 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CH25H	O95992	272 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	BGLAP	P02818	100 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FUT1	P19526	365 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FPR1	P21462	350 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	RRM2	P31350	389 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PTGER4	P35408	488 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PER3	P56645	1201 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	IL1RL1	Q01638	556 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CHRNB3	Q05901	458 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	LTB	Q06643	244 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ST3GAL3	Q11203	375 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FOXF2	Q12947	444 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CCNI	Q14094	377 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZSCAN26	Q16670	478 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	FCRLA	Q7L513	359 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC103	Q8IW40	242 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM99	Q8N816	258 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CALHM2	Q9HA72	323 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	C12orf10	Q9HB07	376 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	VNN3	Q9NY84	501 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744		Q9UFV3	132 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	RNF6	Q9Y252	685 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	HCFC1	P51610	2035 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	CD8B2	A6NJW9	211 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	AQP12B	A6NM10	295 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	ENO4	A6NNW6	628 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744		M0R082	166 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	NPIPB7	O75200	414 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	IL2RA	P01589	272 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	GPI	P06744	558 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	UMPS	P11172	480 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RPL4-208	ENST00000564744	IFI30	P13284	250 aa		7.59	□□□□□ -1.19

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