RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560120.5

BUB1B-211, Transcript of BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase B, human

TSL 3

Gene BUB1B, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BUB1B-211	ENST00000560120	CCNA2	P20248	432 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	HOXC5	Q00444	222 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	PDK3	Q15120	406 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	OR1Q1	Q15612	314 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	FXN	Q16595	210 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	EPYC	Q99645	322 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	EMC3	Q9P0I2	261 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	HCFC1	P51610	2035 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120		A0A087WUJ7	227 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120		A8MXE2	369 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	GPR171	O14626	319 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	TPST2	O60704	377 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	FZD7	O75084	574 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	IMPDH2	P12268	514 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	AGTR1	P30556	359 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	IFNA8	P32881	189 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	OR2B6	P58173	313 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	H3F3A	P84243	136 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SLC25A3	Q00325	362 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SORD	Q00796	357 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	NPTX1	Q15818	432 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	VWA1	Q6PCB0	445 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	CARM1	Q86X55	608 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ABHD3	Q8WU67	409 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	STARD4	Q96DR4	205 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	PROCR	Q9UNN8	238 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	CACNA1C	Q13936	2221 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	PTPN13	Q12923	2485 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	GSC2	O15499	205 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	VAMP5	O95183	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	CGA	P01215	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	YES1	P07947	543 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	THRB	P10828	461 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	COX6B1	P14854	86 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	FPR1	P21462	350 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SLC16A1	P53985	500 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	SIRPA	P78324	504 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	EGR4	Q05215	589 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	BNIP2	Q12982	314 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BUB1B-211	ENST00000560120	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.23	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms