RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550331.1

NEK3-201, Transcript of NIMA related kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NEK3, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3-201ENST00000550331 MUS81Q96NY9 551 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 INPP5KQ9BT40 448 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 DPY30Q9C005 99 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.7□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 WDR45Q9Y484 360 aa6.7□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.69□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 E7EQL1 145 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 ZNF208O43345 1280 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 NTF4P34130 210 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.69□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 FAM234BA2RU67 622 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 AGAP5A6NIR3 686 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 E9PBE3 544 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 M0R1B8 84 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 FAAHO00519 579 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 ITGA5P08648 1049 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 FAM157CP0CG43 387 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 SLC35A1P78382 337 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 RAB35Q15286 201 aa6.68□□□□□ -1.34
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NEK3-201ENST00000550331 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 CASP12Q6UXS9 341 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 ANKRD46Q86W74 232 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK3-201ENST00000550331 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.68□□□□□ -1.34
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