RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TCFL5Q9UL49 500 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 B4DXG7 233 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 RAB36O95755 333 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 COX6A1P12074 109 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CD79BP40259 229 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SLC6A8P48029 635 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 RGS6P49758 472 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 RAB15P59190 212 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 FHL1Q13642 323 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF74Q16587 644 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TMEM156Q8N614 296 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CT55Q8WUE5 264 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 FCGR1BQ92637 280 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SLC35B4Q969S0 331 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TAAR9Q96RI9 348 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 MMP25Q9NPA2 562 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ADAMTS20P59510 1910 aa7.66□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 H7C1C5 153 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SUSD5O60279 629 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 OR7A10O76100 309 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TNFSF15O95150 251 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ONECUT2O95948 504 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 HIST1H2ABP04908 130 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF3P17036 446 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ACVR2AP27037 513 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 GRK5P34947 590 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TGFBR2P37173 567 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 LCN6P62502 163 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 FOXK1P85037 733 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 E2F1Q01094 437 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 LTBQ06643 244 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 RAB40BQ12829 278 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 EFR3AQ14156 821 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 KLHL22Q53GT1 634 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 MRGPREQ86SM8 312 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 FGF11Q92914 225 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 YIPF6Q96EC8 236 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 Q96M85 177 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 LRFN5Q96NI6 719 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TSSK2Q96PF2 358 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 DOK1Q99704 481 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CDC6Q99741 560 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CMC2Q9NRP2 79 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PQD3 144 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 HK1P19367 917 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 F8A1P23610 371 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 HCCSP53701 268 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CTXN1P60606 82 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 IRF3Q14653 427 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ALG10Q5BKT4 473 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SLC6A19Q695T7 634 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 GPR119Q8TDV5 335 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ELP5Q8TE02 316 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 CENPOQ9BU64 300 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 MND1Q9BWT6 205 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-215ENST00000549143 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms