RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL26Q53HC5 615 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDKL2Q92772 493 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDS1Q92903 461 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CACNG2Q9Y698 323 aa8.67□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MANBAO00462 879 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF264O43296 627 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4F21O95013 312 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMS2P2O95744 297 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NR4A1P22736 598 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRABP2P29373 138 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF154Q13106 437 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINGO2Q7L985 606 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM139Q8IV31 216 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST7LQ8TDW4 575 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIMAP5Q96F15 307 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRI1Q9BV20 369 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACPTQ9BZG2 426 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHIAQ9BZP6 476 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFU1Q9UMS0 254 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.66□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN25C9JDP6 229 aa8.65□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPIG6BO95866 241 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBL4AP11441 157 aa8.65□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CBR1P16152 277 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCN1P31025 176 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EVX1P49640 407 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDCD1Q15116 288 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIN4Q56A73 249 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPAT4Q86UL3 456 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MDP1Q86V88 176 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARP8Q8N3A8 854 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01006Q8NI28 216 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF18AQ8NI77 898 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMD4Q96H15 378 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTBD2Q9BX70 525 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS11Q9H270 941 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NELFAQ9H3P2 528 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C5orf63A6NC05 138 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRS3O43559 492 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXH1O75593 365 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UPK3AO75631 287 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OTCP00480 354 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OPN1MWP04001 364 aa8.64□□□□□ -1.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2P06681 752 aa8.64□□□□□ -1.03
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