RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 Q7L0L9 218 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FANK1Q8TC84 345 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRHL3Q8TE85 626 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RFT1Q96AA3 541 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SDF2Q99470 211 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TEAD3Q99594 435 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFT27Q9BW83 186 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POFUT1Q9H488 388 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NIPAL2Q9H841 368 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 POLHQ9Y253 713 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIOO75962 3097 aa6.05□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 A0A1W2PQ72 361 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EPOPA6NHQ4 379 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC31A1O15431 190 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC19A2O60779 497 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FZD7O75084 574 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SCO1O75880 301 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOX30O94993 753 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5F1O95221 314 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGB2P05107 769 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HMGN1P05114 100 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADRB1P08588 477 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SSTR2P30874 369 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PYCR1P32322 319 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PITPNBP48739 271 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIN1Q13671 783 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CRMP1Q14194 572 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GALEQ14376 348 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NTRK2Q16620 822 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMUG1Q53HV7 270 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CT83Q5H943 113 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HBMQ6B0K9 141 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VITQ6UXI7 678 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTSS1LQ765P7 747 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRROSQ86YC3 692 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SIAH3Q8IW03 269 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM239Q8WW34 195 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 THAP4Q8WY91 577 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C16orf92Q96LL3 132 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL21RQ9HBE5 538 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CACNG2Q9Y698 323 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LEUTXA8MZ59 168 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRN3E7EW58 273 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PSMD9O00233 223 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CTSVO60911 334 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R3DO95685 299 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MT-ND4P03905 459 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATF1P18846 271 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NDUFS1P28331 727 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFNA8P32881 189 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTNR1BP49286 362 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CST6Q15828 149 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GXYLT1Q4G148 440 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TP53I3Q53FA7 332 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TOR2AQ5JU69 321 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF425Q6IV72 752 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDC73Q6P1J9 531 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OAFQ86UD1 273 aa6.04□□□□□ -1.44
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms