RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	STON2	Q8WXE9	905 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	OR52B2	Q96RD2	323 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PANX1	Q96RD7	426 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	UPB1	Q9UBR1	384 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CR1	P17927	2039 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170		A0A1W2PR80	420 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	AGAP5	A6NIR3	686 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170		E7EQL1	145 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170		M0R1B8	84 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	AP3D1	O14617	1153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CHRM4	P08173	479 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	ITGA5	P08648	1049 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	NTF4	P34130	210 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	MAP2K6	P52564	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	NME5	P56597	212 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	DSCR9	P59020	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	H3F3A	P84243	136 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	GABRA6	Q16445	453 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	SYPL1	Q16563	259 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	MUC15	Q8N387	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	ANKFN1	Q8N957	763 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	COL6A5	A8TX70	2615 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM72	A0PK05	275 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	FAAH	O00519	579 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	NR2F1	P10589	423 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IDO1	P14902	403 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IL7R	P16871	459 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	TACR3	P29371	465 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC1A3	P43003	542 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	FABP6	P51161	128 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	UFM1	P61960	85 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	OR52E6	Q96RD3	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	ZBTB18	Q99592	522 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PDLIM1	O00151	329 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IFNA2	P01563	188 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	C1QC	P02747	245 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PGR	P06401	933 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IMPDH2	P12268	514 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	BMP4	P12644	408 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IL12A	P29459	219 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	CDKN2C	P42773	168 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	IDH3A	P50213	366 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	EPS8	Q12929	822 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	RAB35	Q15286	201 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	GSTA3	Q16772	222 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPL55-231	ENST00000492170	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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