RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM247A6NEH6 219 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SHISA8B8ZZ34 492 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP6CO00743 305 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GMFGO60234 142 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TMCC2O75069 709 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GMNNO75496 209 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 IL3P08700 152 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FCGR2AP12318 317 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPAN8P19075 237 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CD247P20963 164 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CD40LGP29965 261 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC6A8P48029 635 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 RAD23AP54725 363 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CSNK2BP67870 215 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PSPHP78330 225 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFA5Q16718 116 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 REG4Q9BYZ8 158 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 RTN4RQ9BZR6 473 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 RMND5AQ9H871 391 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SP140LQ9H930 580 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX5Q9Y5X3 404 aa10.51□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01387J3KSC0 135 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FADS1O60427 444 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 IFNA2P01563 188 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PCMT1P22061 227 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CTBP2P56545 445 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FADDQ13158 208 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 DGUOKQ16854 277 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM9CQ8IZT9 166 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 OR7G2Q8NG99 324 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 BRF2Q9HAW0 419 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SDHAF3Q9NRP4 125 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX6Q9UNH7 406 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 G3V2T6 193 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 OTCP00480 354 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 S100A1P23297 94 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CDKN1AP38936 164 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 RFX3P48380 749 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CDH13P55290 713 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 ISL1P61371 349 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 NEDD8Q15843 81 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CTF1Q16619 201 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF691Q5VV52 312 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 MARCH3Q86UD3 253 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GGNQ86UU5 652 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP21Q9H596 190 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GIMAP4Q9NUV9 329 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 BAG5Q9UL15 447 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 ABCG2Q9UNQ0 655 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa10.48□□□□□ -0.73
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms