RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 C1orf50Q9BV19 199 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 FKRPQ9H9S5 495 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 EMC3Q9P0I2 261 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 UPB1Q9UBR1 384 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.35□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM72A0PK05 275 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFS8O00217 210 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 NR5A2O00482 541 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 AP3D1O14617 1153 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 GPR171O14626 319 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM13O60858 407 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 STX11O75558 287 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 STAMBPO95630 424 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PF4P02776 101 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 KRT16P08779 473 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 OR12D1P0DN82 309 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 NEFHP12036 1026 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF23P17027 643 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ITGA2P17301 1181 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ALDH3A1P30838 453 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ARRB2P32121 409 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINF1P36955 418 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 HPCAL1P37235 193 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEA8P43361 318 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 CCT5P48643 541 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PRPS1P60891 318 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 LGALS3BPQ08380 585 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SQLEQ14534 574 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SLC17A1Q14916 467 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PCLAFQ15004 111 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PGS1Q32NB8 556 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 EMBQ6PCB8 327 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 VHLLQ6RSH7 139 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 CASP12Q6UXS9 341 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF563Q8TA94 476 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PIGXQ8TBF5 258 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 AGR3Q8TD06 166 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SFXN5Q8TD22 340 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM234Q8WY98 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 RAB8BQ92930 207 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TRMOQ9BU70 441 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 DUSP26Q9BV47 211 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 OR51I1Q9H343 314 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-208ENST00000479480 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM129A0AVI4 362 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM23A6NLE4 172 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM114B3SHH9 223 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 COPEO14579 308 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 TCF21O43680 179 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 VENTXO95231 258 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 OR4A8P0C604 315 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 LYNX1P0DP58 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 G6PDP11413 515 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 CFPP27918 469 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 MPGP29372 298 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 CALCRP30988 508 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 SOAT1P35610 550 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 TUBA1BP68363 451 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 TUBA4AP68366 448 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 KCNJ10P78508 379 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 HGFACQ04756 655 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 FUT5Q11128 374 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 ADIPOQQ15848 244 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 XKR7Q5GH72 579 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa7.33□□□□□ -1.24
CTPS1-208ENST00000479480 TUBA1AQ71U36 451 aa7.33□□□□□ -1.24
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