RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 H0YIV9 168 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 TNFSF11O14788 317 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FADS1O60427 444 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 KERAO60938 352 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ADAP00813 363 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ATP1B1P05026 303 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ALPLP05186 524 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 TUBBP07437 444 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CTAGE8P0CG41 777 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 PSG1P11464 419 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 HNF1AP20823 631 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 USF1P22415 310 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 IVDP26440 423 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 TACR3P29371 465 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 AGTR1P30556 359 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 THBS4P35443 961 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FNTAP49354 379 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 RAB10P61026 200 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GTF2H2Q13888 395 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 MORF4L2Q15014 288 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 RAB35Q15286 201 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CARTPTQ16568 116 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 LIPJQ5W064 366 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GALNT10Q86SR1 603 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ISCA2Q86U28 154 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CCDC25Q86WR0 208 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 OR9A2Q8NGT5 310 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ABHD3Q8WU67 409 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 HSD17B8Q92506 261 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 VSTM2LQ96N03 204 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 BTBD9Q96Q07 612 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SERPINI1Q99574 410 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 NPAS1Q99742 590 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 PTGES2Q9H7Z7 377 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 NGBQ9NPG2 151 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAIMQ9NVQ4 179 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 RNF14Q9UBS8 474 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 AP4B1Q9Y6B7 739 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.92□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 C1orf226A1L170 272 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 AQP7P3A6NL99 342 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 C9JVG2 144 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 RAB27BO00194 218 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ABCD4O14678 606 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 LYZL6O75951 148 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SEMA3DO95025 777 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLDN9O95484 217 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC25A16P16260 332 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ITGA2P17301 1181 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 IL11P20809 199 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SSTR1P30872 391 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SFTPDP35247 375 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FABP6P51161 128 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ARFIP1P53367 373 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 PNLIPRP2P54317 469 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 DSCR9P59020 149 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 SPOCK1Q08629 439 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 IFT88Q13099 833 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 NRF1Q16656 503 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 AGAP6Q5VW22 663 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FRG2Q64ET8 278 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 HBMQ6B0K9 141 aa4.91□□□□□ -1.62
RPS6KC1-203ENST00000468069 FAM166AQ6J272 317 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms