RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PHOX2BQ99453 314 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 FKRPQ9H9S5 495 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CMC2Q9NRP2 79 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.4□□□□□ -1.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.4□□□□□ -1.06
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SCN2AQ99250 2005 aa8.4□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC22A1O15245 554 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRODHO43272 600 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 PIP5K1CO60331 668 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SOX14O95416 240 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT-ND2P03891 347 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 LIPCP11150 499 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRKCAP17252 672 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPR4P46093 362 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 IRF3Q14653 427 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF74Q16587 644 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DCAF10Q5QP82 559 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 AHSA2Q719I0 299 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 STMN3Q9NZ72 180 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.39□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCO2O43819 266 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRKYO43930 277 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 ENTPD6O75354 484 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC25A12O75746 678 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 CBR3O75828 277 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 INMTO95050 263 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATE1O95260 518 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUDT14O95848 222 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 TXNDC12O95881 172 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 HK1P19367 917 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 MASP1P48740 699 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCR4P51679 360 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 RRADP55042 308 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 FOXK2Q01167 660 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB40BQ12829 278 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 NFATC3Q12968 1075 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL10RAQ13651 578 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYT14P1Q58G82 188 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 EMC4Q5J8M3 183 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 STX19Q8N4C7 294 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMER2Q8N7J2 671 aa8.38□□□□□ -1.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR2M3Q8NG83 312 aa8.38□□□□□ -1.07
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