RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435145.6

HLA-DQB2-231, Transcript of major histocompatibility complex, class II, DQ beta 2, human

BASIC

Gene HLA-DQB2, Length 2,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	UBL3	O95164	117 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RAB25	P57735	213 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SKP1	P63208	163 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LGALS3BP	Q08380	585 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	BCORP1	Q8N888	145 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OR4C3	Q8NH37	302 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	C3orf49	Q96BT1	292 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	KLHL1	Q9NR64	748 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NCDN	Q9UBB6	729 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CD207	Q9UJ71	328 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145		A0A1B0GVC2	190 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	C7orf66	A4D0T2	115 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145		A6NIN4	97 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNF749	O43361	778 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CSTA	P01040	98 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	IGF2	P01344	180 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	THEGL	P0DJG4	465 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	IL10RA	Q13651	578 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CCIN	Q13939	588 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PON3	Q15166	354 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	DTX3	Q8N9I9	347 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	YIPF5	Q969M3	257 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	DGAT2	Q96PD7	388 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LRRN3	E7EW58	273 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GNB5	O14775	395 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	FLRT2	O43155	660 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CLPS	P04118	112 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SPI1	P17947	270 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GABRA4	P48169	554 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	MMP15	P51511	669 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	BTG2	P78543	158 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	HSF2	Q03933	536 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	C1orf61	Q13536	156 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	RAB30	Q15771	203 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	KLHL26	Q53HC5	615 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	C6orf183	Q5T699	404 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	HSD17B8	Q92506	261 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	PHYHIP	Q92561	330 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SCMH1	Q96GD3	660 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	COPS3	Q9UNS2	423 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OR6C68	A6NDL8	312 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GPRIN2	O60269	458 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CTSE	P14091	401 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GALNS	P34059	522 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	MAB21L1	Q13394	359 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NTRK2	Q16620	822 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	LIPH	Q8WWY8	451 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CMTM3	Q96MX0	182 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	NMNAT3	Q96T66	252 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	OR10A5	Q9H207	317 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SPATA2	Q9UM82	520 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145		A0A1B0GTQ1	180 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CLDN4	O14493	209 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
HLA-DQB2-231	ENST00000435145	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05

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