RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 ADH6P28332 368 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SLC7A1P30825 629 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HTR3AP46098 478 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CDH12P55289 794 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 DLX5P56178 289 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PON3Q15166 354 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ALG10BQ5I7T1 473 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ZNF613Q6PF04 617 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ULK3Q6PHR2 472 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 GCNT2Q8N0V5 402 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR10D3Q8NH80 312 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 C3orf49Q96BT1 292 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ADGRG7Q96K78 797 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SELENONQ9NZV5 590 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 RHCGQ9UBD6 479 aa11.25□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HCFC1P51610 2035 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 FKBP6O75344 327 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 AQP8O94778 261 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PRSS23O95084 383 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR5F1O95221 314 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 IL2RAP01589 272 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 FUT4P22083 530 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CXCR1P25024 350 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CHRNB4P30926 498 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 IFNA8P32881 189 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TIMP3P35625 211 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 MAGEA2P43356 314 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SGCBQ16585 318 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HBMQ6B0K9 141 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OSTF1Q92882 214 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 WNT2BQ93097 391 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SLC38A4Q969I6 547 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PRRC1Q96M27 445 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 KLHL15Q96M94 604 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 FNDC11Q9BVV2 318 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SRXN1Q9BYN0 137 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR11A1Q9GZK7 315 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 AP4S1Q9Y587 144 aa11.24□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SLC22A20A6NK97 555 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ADAMDEC1O15204 470 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 LYPD3O95274 346 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PNMTP11086 282 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 KLK2P20151 261 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 AGAP20933 346 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 BMP5P22003 454 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ELK4P28324 431 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ST3GAL3Q11203 375 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ELOA3Q8NG57 546 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR2V1Q8NHB1 315 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 LILRB4Q8NHJ6 448 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ASB5Q8WWX0 329 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 OR5B2Q96R09 309 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 UCN2Q96RP3 112 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 ZNF347Q96SE7 839 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 PIP5K1AQ99755 562 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 C12orf10Q9HB07 376 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CHRNA9Q9UGM1 479 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.23□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 CACNA1CQ13936 2221 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 A0A087WUJ7 227 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 TMEM72A0PK05 275 aa11.22□□□□□ -0.61
CNMD-201ENST00000377962 HSPB2A8KAH6 182 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms