RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF233A6NK53 670 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GJE1A6NN92 205 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EVPLLA8MZ36 301 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MPPED1O15442 326 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 XRCC3O43542 346 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LDB3O75112 727 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYO1DO94832 1006 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PSKH1P11801 424 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDK4P11802 303 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCNE1P24864 410 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AXLP30530 894 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GABRA5P31644 462 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EVI2BP34910 448 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ART1P52961 327 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IST1P53990 364 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NCKAP1LP55160 1127 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD81P60033 236 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPS18P62269 152 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TGM3Q08188 693 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GPR50Q13585 617 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TFDP1Q14186 410 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC15A2Q16348 729 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HKDC1Q2TB90 917 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ALKBH6Q3KRA9 238 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 Q3ZCU0 254 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf189Q5VU69 101 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KIRREL2Q6UWL6 708 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FJX1Q86VR8 437 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UBQLNLQ8IYU4 475 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM47BQ8NA70 645 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NPEPL1Q8NDH3 523 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FRZBQ92765 325 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM203Q969S6 136 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TADA1Q96BN2 335 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ORAI1Q96D31 301 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DYNLL2Q96FJ2 89 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf72Q96LT7 481 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 APOL4Q9BPW4 351 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 VPS25Q9BRG1 176 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PBDC1Q9BVG4 233 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GSDMCQ9BYG8 508 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM15Q9C019 465 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SYT4Q9H2B2 425 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf49Q9H6J7 331 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FKRPQ9H9S5 495 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MCCC2Q9HCC0 563 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TIGARQ9NQ88 270 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPAG17Q6Q759 2223 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GUH1 482 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEB16A2A368 324 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A8MU76 341 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 WRBO00258 174 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CHST1O43916 411 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SOX30O94993 753 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYL12AP19105 171 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CFL1P23528 166 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 P2RY2P41231 377 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NPBWR1P48145 328 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MMP15P51511 669 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HMGCS1Q01581 520 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ST3GAL4Q11206 333 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ILKQ13418 452 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL22Q53GT1 634 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ADNP2Q6IQ32 1131 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UGT2A3Q6UWM9 527 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT10Q86SR1 603 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00471Q8N535 108 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM86B1Q8N7N1 296 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ENGASEQ8NFI3 743 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UBTD2Q8WUN7 234 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RNF138Q8WVD3 245 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf54Q8WWF1 131 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EME1Q96AY2 570 aa2.25□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB39BQ96DA2 213 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms