RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SAXO2Q658L1 398 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT74Q7RTS7 529 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC103Q8IW40 242 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GLS2Q9UI32 602 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 NINQ8N4C6 2090 aa6.48□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 M0R082 166 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SYT5O00445 386 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HPP00738 406 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ATP1B1P05026 303 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 BMP5P22003 454 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 S100GP29377 79 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MTNR1AP48039 350 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM80Q96HE8 168 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 COL4A6Q14031 1691 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SMIM30A4D0T7 59 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A20A6NK97 555 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 VGLL3A8MV65 326 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CENPBD1B2RD01 187 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ARL6IP5O75915 188 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 AGFG2O95081 481 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ETV5P41161 510 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PCYT1AP49585 367 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TSPAN5P62079 268 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SELENBP1Q13228 472 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 IDNKQ5T6J7 187 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.47□□□□□ -1.37
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LRRTM3-201ENST00000361320 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C10orf90Q96M02 699 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPA12AO43301 675 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXS1O43638 330 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 CLUP10909 449 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 HTR5AP47898 357 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ACTC1P68032 377 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ACTA1P68133 377 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PUDPQ08623 228 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 FAPQ12884 760 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PYDC2Q56P42 97 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TRILQ7L0X0 811 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR34Q96EX3 536 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR160Q9UJ42 338 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PROCRQ9UNN8 238 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 AGAP5A6NIR3 686 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF879B4DU55 563 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 DRD5P21918 477 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ACP1P24666 158 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 SYT14P1Q58G82 188 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 BICRALQ6AI39 1079 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF627Q7L945 461 aa6.46□□□□□ -1.37
LRRTM3-201ENST00000361320 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.46□□□□□ -1.37
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