RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361311.4

CLSTN1-201, Transcript of calsyntenin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN1, Length 4,647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1-201ENST00000361311 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PHYHO14832 338 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SHOXO15266 292 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 RAB6AP20340 208 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 MAOBP27338 520 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF175Q9Y473 711 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM202A6NGA9 273 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 CBR1P16152 277 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 FBXL6Q8N531 539 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 RNF141Q8WVD5 230 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PMM1Q92871 262 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 DLL4Q9NR61 685 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.85□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PLPP1O14494 284 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 LATO43561 262 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PPT1P50897 306 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 CAPZA1P52907 286 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PRPS1P60891 318 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ST3GAL2Q16842 350 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 CDC6Q99741 560 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ADAM12O43184 909 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 H2BFMP0C1H6 154 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TIMP2P16035 220 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC6A1P30531 599 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TLE2Q04725 743 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 LNX2Q8N448 690 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 STK35Q8TDR2 534 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PHYHIPQ92561 330 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 HMGA2P52926 109 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 BDH1Q02338 343 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 BAMBIQ13145 260 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 IRF3Q14653 427 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 C3orf49Q96BT1 292 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.84□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 FBXO24O75426 580 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 MED6O75586 246 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 GP1BBP13224 206 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 HCCSP53701 268 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 INSL4Q14641 139 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TOMM20Q15388 145 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 RPE65Q16518 533 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 DCST2Q5T1A1 773 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM106AQ96A25 262 aa14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CLSTN1-201ENST00000361311 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 OR8U9P0C7N5 309 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 TAS2R31P59538 309 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 CBLCQ9ULV8 474 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 TRIM64BA6NI03 449 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 KIAA0355O15063 1070 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 PAPLNO95428 1278 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 LIMS3P0CW19 117 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 LIMS4P0CW20 117 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 GAAP10253 952 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 SYN1P17600 705 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 SDHBP21912 280 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 SLC6A9P48067 706 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 Q499Y3 187 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 CDH26Q8IXH8 852 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 CREBZFQ9NS37 354 aa14.83□□□□□ -0.04
CLSTN1-201ENST00000361311 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms