RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 QPRTQ15274 297 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 ZFP41Q8N8Y5 198 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 LIPHQ8WWY8 451 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 TAAR8Q969N4 342 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 TBX5Q99593 518 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 NANSQ9NR45 359 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 STUB1Q9UNE7 303 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 CORINQ9Y5Q5 1042 aa16.27■□□□□ 0.2
ACTB-201ENST00000331789 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 J3QRK9 145 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZFAND5O76080 213 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 UMODP07911 640 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 GHDCQ8N2G8 530 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR8K3Q8NH51 312 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMEM203Q969S6 136 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 LRFN5Q96NI6 719 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 JAM3Q9BX67 310 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NRIP3Q9NQ35 241 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 KLHL21Q9UJP4 597 aa16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 IMPA2O14732 288 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ASAH2BP0C7U1 165 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PRPS1P60891 318 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TPBGQ13641 420 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PCOLCEQ15113 449 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 LRRC75AQ8NAA5 344 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 MCFD2Q8NI22 146 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 RASD2Q96D21 266 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 KATNB1Q9BVA0 655 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 MYOTQ9UBF9 498 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 HIF3AQ9Y2N7 669 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.26■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 METTL15A6NJ78 407 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C4orf47A7E2U8 309 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 B4DXG7 233 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR2J2O76002 312 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CYC1P08574 325 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CD59P13987 128 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CCKBRP32239 447 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CLDN6P56747 220 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 RPS25P62851 125 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ARMC4Q5T2S8 1044 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 BICRALQ6AI39 1079 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 BORCS5Q969J3 196 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMCO6Q96DC7 493 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NMNAT3Q96T66 252 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMEM72A0PK05 275 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 B4E171 279 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 C9J4A7 227 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 PLD2O14939 933 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ARPC3O15145 178 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 BGLAPP02818 100 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 CELA2AP08217 269 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TSPAN7P41732 249 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 TMED1Q13445 227 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 BTBD16Q32M84 506 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 LYPD8Q6UX82 237 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 ADGRG3Q86Y34 549 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 NPEPL1Q8NDH3 523 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.25■□□□□ 0.19
ACTB-201ENST00000331789 OR52N1Q8NH53 320 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms