RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 C14orf105Q9NVL8 296 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 TAS2R16Q9NYV7 291 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PRODH2Q9UF12 536 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CMAHPQ9Y471 501 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 C9orf172C9J069 976 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 H3BUI4 141 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 TSPAN4O14817 238 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 UMODP07911 640 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PRKAR1BP31321 381 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GALNSP34059 522 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 RORCP51449 518 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 OR5M3Q8NGP4 307 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SLC46A1Q96NT5 459 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 B4E171 279 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PLA2G10O15496 165 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SEC14L5O43304 696 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ADAM11O75078 769 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 THY1P04216 161 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 DBIP07108 87 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 NID1P14543 1247 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 TSPAN7P41732 249 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 TAS2R41P59536 307 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 RUNX1T1Q06455 604 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 MICAQ29983 383 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ENTPD8Q5MY95 495 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PIP4P1Q86T03 277 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 MCHR1Q99705 422 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 FNDC11Q9BVV2 318 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PCNX2A6NKB5 2137 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 WWP2O00308 870 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 REM1O75628 298 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SERPINI2O75830 405 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CCNB2O95067 398 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GASTP01350 101 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 IFI6P09912 130 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 HTR2AP28223 471 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 LIMS1P48059 325 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GPR143P51810 404 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PER3P56645 1201 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 E2F1Q01094 437 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 BIKQ13323 160 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 MAB21L1Q13394 359 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 NCF4Q15080 339 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SSX1Q16384 188 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 OR8H3Q8N146 312 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GDPD1Q8N9F7 314 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GRHL3Q8TE85 626 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 HYLS1Q96M11 299 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SNTG1Q9NSN8 517 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 KLHL28Q9NXS3 571 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 KCND3Q9UK17 655 aa10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CIB4A0PJX0 185 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 CDHR4A6H8M9 788 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 C9J4A7 227 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 OR10H3O60404 316 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 AK1P00568 194 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 FTH1P19P0C7X4 201 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 NBL1P41271 181 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 PPICP45877 212 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF136P52737 540 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 GALEQ14376 348 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 DECR1Q16698 335 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 SLC29A4Q7RTT9 530 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 HDDC2Q7Z4H3 204 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CDCA8-201ENST00000327331 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms