RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 NR2F6P10588 404 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SDC2P34741 201 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SOAT1P35610 550 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 AVPR1BP47901 424 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SMCO1Q147U7 214 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 COX20Q5RI15 118 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ELP2Q6IA86 826 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 BBS4Q96RK4 519 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CD180Q99467 661 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CLEC2DQ9UHP7 191 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ETFAP13804 333 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 GNSP15586 552 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 GANABQ14697 944 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 GUCA2BQ16661 112 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 FAM76BQ5HYJ3 339 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 AVPI1Q5T686 147 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 LIPKQ5VXJ0 399 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF613Q6PF04 617 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 RHOUQ7L0Q8 258 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC116Q8IYX3 515 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRA2Q9H9E1 313 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ENAMQ9NRM1 1142 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SUSD2Q9UGT4 822 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 FBXW2Q9UKT8 454 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM131Q92545 1883 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TRIOO75962 3097 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PGRMC2O15173 223 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TCAPO15273 167 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PIP5K1CO60331 668 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 IFI6P09912 130 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD34CP0C6C1 535 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PVRP15151 417 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TYRP1P17643 537 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 MPIP34949 423 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 STX4Q12846 297 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SCARB2Q14108 478 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CRB2Q5IJ48 1285 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PMS2CLQ68D20 193 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM91Q6ZNR0 172 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF681Q96N22 645 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PISDQ9UG56 409 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 DAPP1Q9UN19 280 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 G3V3Q6 166 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SEMA7AO75326 666 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 GP1BAP07359 652 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ST6GAL1P15907 406 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 GABRB1P18505 474 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CRYBB2P43320 205 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SRP9P49458 86 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 LIM2P55344 173 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TAS2R60P59551 318 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 MAJINQ3KP22 176 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 C18orf63Q68DL7 685 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF367Q7RTV3 350 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 C6orf120Q7Z4R8 191 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 NAA40Q86UY6 237 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 EDAQ92838 391 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A46Q96AG3 418 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 C5AR2Q9P296 337 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ACSL6Q9UKU0 697 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 SPACA6W5XKT8 324 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 NCR1O76036 304 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 PPP1CAP62136 330 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 CDK6Q00534 326 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 HSPB3Q12988 150 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXA3-201ENST00000317201 DEFB133Q30KQ1 61 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms