RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR10A5Q9H207 317 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 KLHL1Q9NR64 748 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 MYO9BQ13459 2157 aa15.88■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ARL6IP5O75915 188 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 C1QBP02746 253 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 EPXP11678 715 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 EFR3AQ14156 821 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 KLHL26Q53HC5 615 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 Q5BKY6 102 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 BICRALQ6AI39 1079 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 C3orf49Q96BT1 292 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 TCTN2Q96GX1 697 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ABCG5Q9H222 651 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ING3Q9NXR8 418 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 SZT2Q5T011 3432 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 B4DGG1 531 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR7A10O76100 309 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 BTCP35070 178 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ERV3-1Q14264 604 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 PARGQ86W56 976 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR51L1Q8NGJ5 315 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC61Q9BV99 259 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NCDNQ9UBB6 729 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR10H1Q9Y4A9 318 aa15.87■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1B0GVC2 190 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 A6NIN4 97 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 LRRN3E7EW58 273 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 IGF2P01344 180 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ATF1P18846 271 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 GALNSP34059 522 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 RPL4P36578 427 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 HSD17B7P56937 341 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 TNK1Q13470 666 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 IL10RAQ13651 578 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 SLC36A2Q495M3 483 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 FAM71CQ8NEG0 241 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 SNX33Q8WV41 574 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 PHYHIPQ92561 330 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NMNAT3Q96T66 252 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 MCUBQ9NWR8 336 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 CACNG2Q9Y698 323 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1W2PPC4 97 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OR6C68A6NDL8 312 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 FLRT2O43155 660 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 UBL3O95164 117 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 CLPSP04118 112 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 SPI1P17947 270 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NUDT1P36639 197 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ADH7P40394 386 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 GABRA4P48169 554 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 RAB25P57735 213 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 PRPS1P60891 318 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 HSF2Q03933 536 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 NNATQ16517 81 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 DTX3Q8N9I9 347 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 RPS4Y2Q8TD47 263 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 MAP3K3Q99759 626 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.85■□□□□ 0.13
CLDN11-201ENST00000064724 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms