RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lcn9Q9D267 178 aa14.93□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc52a3Q9D6X5 460 aa14.93□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr634-ps1A0A1B0GRN7 318 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccr4P51680 360 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fxyd2Q04646 70 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Morn4Q6PGF2 146 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Flywch1Q8CI03 673 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc25a34A2ADF7 318 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata6lB2RV46 347 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arl9F7BE40 171 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BckdkO55028 412 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P03987 398 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ArafP04627 604 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmprss11bQ14C59 416 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Obox3Q3UT54 335 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itpripl2Q3UV16 535 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr309Q7TS01 308 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf592Q8BHZ4 1262 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp189Q8BKP2 608 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd46Q8BTZ5 228 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam69bQ99ML4 431 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Actl11Q9D5V1 1207 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgf20Q9ESL9 211 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Six6Q9QZ28 246 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Brca2P97929 3329 aa14.92□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rd3lB2RV38 197 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptrhd1D3Z4S3 140 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-M11F6U8V3 335 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r168K7N6B6 309 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1360K9J6X0 313 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrkcaP20444 672 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ube2mP61082 183 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ptchd1Q14B62 888 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C130050O18RikQ497Y9 356 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NnatQ61979 81 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1359Q7TQU5 313 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cmtm4Q8CJ61 208 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc36Q8VBW8 186 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lipt1Q8VCM4 373 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LgalslQ8VED9 172 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ScgnQ91WD9 276 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc25a30Q9CR58 291 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgat4cQ9D306 478 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc15a1Q9JIP7 709 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1095A3KPP7 308 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr610E9Q598 315 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc38a6G3UVW3 457 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4141K9J7H2 306 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp5a1Q03265 553 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlk1Q09163 385 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Riiad1Q3KNY5 119 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnk6Q3TBV4 313 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spire1Q52KF3 598 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HlxQ61670 476 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 BocQ6AZB0 1110 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RetnlaQ9EP95 111 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr44Q9EQB8 314 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cts6Q9ET52 334 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lgi1Q9JIA1 557 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uchl1Q9R0P9 223 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mid1O70583 680 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pou3f3P31361 497 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9a3r1P70441 355 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf7Q00417 419 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm906Q3V0M1 1017 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CfiQ61129 603 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubfd1Q78JW9 368 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5346Q7M766 736 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slitrk2Q810C0 846 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oscp1Q8BHW2 379 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc22a6Q8VC69 545 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rtn4ip1Q924D0 396 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RfxankQ9Z205 269 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mocs2Q9Z223 189 aa14.91□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdh1F7BJK1 1077 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fpr1P33766 364 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TpoP35419 914 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FahP35505 419 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Carnmt1Q80UY1 400 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc29Q80VM3 471 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep68Q8C0D9 733 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HinfpQ8K1K9 503 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr935Q8VG16 308 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phyhd1Q9DB26 291 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacna1eQ61290 2272 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4a32A2A8T1 509 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa14.9□□□□□ -0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8871F7AXK2 190 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms