RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxl14Q8BID8 400 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Baiap2Q8BKX1 535 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nfatc4Q8K120 901 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1094Q8VF13 330 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hemk1Q921L7 340 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nox4Q9JHI8 578 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 RlimQ9WTV7 600 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 TrdcA0A0G2JEU3 153 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam209A2APA5 170 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Srp54bE9PXC0 504 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr655E9Q252 308 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr420E9Q4G0 321 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr190K7N5T5 307 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 RaxO35602 342 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 UgdhO70475 493 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sbk2P0C5K1 362 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fabp7P51880 132 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Perm1Q149B8 807 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Msto1Q2YDW2 556 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eci3Q78JN3 317 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ap1s3Q7TN05 154 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ube2q1Q7TSS2 422 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Znf689Q8BKK5 500 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Flrt2Q8BLU0 660 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Asb16Q8VHS5 453 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrch4Q921G6 680 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 TpbpbQ9CQC0 121 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rab3bQ9CZT8 219 aa10.66□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp442A2AQA0 667 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atxn7l3A2AWT3 347 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr601A2RS33 314 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr727A2RTN7 324 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 4930451I11RikE9Q9R3 111 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gpr31F8VQN3 319 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fcn2O70497 314 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kcne1P23299 129 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 CpeQ00493 476 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Grhl3Q5FWH3 603 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr128Q7TRJ1 308 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sult2a8Q8BGL3 282 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Psmf1Q8BHL8 271 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rtn4ip1Q924D0 396 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sorcs1Q9JLC4 1167 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dctn6Q9WUB4 190 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf165E9QAU8 347 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21812J3QN84 227 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dsg2O55111 1122 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 DgkaO88673 730 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mup3P04939 184 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ceacam1P31809 521 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eri1Q7TMF2 345 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Carnmt1Q80UY1 400 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc5a7Q8BGY9 580 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc35b4Q8CIA5 331 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rab38Q8QZZ8 211 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rhbdl1Q8VC82 373 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1232Q8VEX7 311 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr821Q8VG45 310 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ceacam2Q925P2 520 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tlr1Q9EPQ1 795 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr44Q9EQB8 314 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cts6Q9ET52 334 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 PtgesQ9JM51 153 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ca5bQ9QZA0 317 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 CorinQ9Z319 1113 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r101E9PZS9 857 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tspan5P62080 268 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 MakQ04859 622 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mtf1Q07243 675 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fam109bQ14B98 259 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Timm8a2Q4FZG7 97 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tas2r143Q7TQB9 293 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kiaa0513Q8R0A7 407 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Or51e2Q8VBV9 320 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc35b3Q922Q5 369 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mbd3l1Q9D9H3 186 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fgf21Q9JJN1 210 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 TapbpQ9R233 465 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 RfxankQ9Z205 269 aa10.65□□□□□ -0.7
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ntn1O09118 604 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ube2mP61082 183 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppp2cbP62715 309 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ppp2caP63330 309 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adra2aQ01338 450 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mtcp1Q60945 107 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 HepacamQ640R3 418 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 CelQ64285 599 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr290Q7TS13 315 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pou6f2Q8BJI4 691 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Yipf6Q8BR70 236 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cpne1Q8C166 536 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem17Q8K0U3 198 aa10.64□□□□□ -0.71
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmed4Q8R1V4 227 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.6 ms