RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	LINC01565	O15544	149 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DDAH2	O95865	285 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	F10	P00742	488 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DBH	P09172	617 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ACP2	P11117	423 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	AQP2	P41181	271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ESX1	Q8N693	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RLIM	Q9NVW2	624 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DAPP1	Q9UN19	280 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PRKAR1B	P31321	381 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CA5A	P35218	305 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NRG4	Q8WWG1	115 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RAB9B	Q9NP90	201 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151		A0A1W2PPC4	97 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SMCO3	A2RU48	225 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	HMX2	A2RU54	273 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151		M0R036	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GAST	P01350	101 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GPX2	P18283	190 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LIM2	P55344	173 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PPP2CB	P62714	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PPP2CA	P67775	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	SLC35A1	P78382	337 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PPA1	Q15181	289 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	COX20	Q5RI15	118 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	LRP5	O75197	1615 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RAB3D	O95716	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ALPL	P05186	524 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ARSB	P15848	533 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CLDN17	P56750	224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FXYD4	P59646	89 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MZT1	Q08AG7	82 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CNIH2	Q6PI25	160 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FNDC8	Q8TC99	324 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	COQ10A	Q96MF6	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151		V9GY05	133 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PRR18	Q8N4B5	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ARL6	Q9H0F7	186 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TSPAN4	O14817	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DNAJB6	O75190	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	KNG1	P01042	644 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF44	P15621	663 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CYB561	P49447	251 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC58	Q4VC31	144 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CACNA1C	Q13936	2221 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	PTH	P01270	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	HTR5A	P47898	357 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CAMK2D	Q13557	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MAVS	Q7Z434	540 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	STOML3	Q8TAV4	291 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM68	Q96MH6	324 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	APMAP	Q9HDC9	416 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	MED17	Q9NVC6	651 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RAB18-208	ENST00000611151	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms