RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF597Q96LX8 424 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CNBD2Q96M20 576 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TSSK2Q96PF2 358 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HBEGFQ99075 208 aa3.78□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CGREF1Q99674 301 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF696Q9H7X3 374 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.77□□□□□ -1.81
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CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V1G1O75348 118 aa3.77□□□□□ -1.81
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CAPNS1-210ENST00000590211 CHIT1Q13231 466 aa3.77□□□□□ -1.81
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CAPNS1-210ENST00000590211 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.77□□□□□ -1.81
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CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.77□□□□□ -1.81
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CAPNS1-210ENST00000590211 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 STHQ8IWL8 128 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TDHQ8IZJ6 230 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPV3Q8NET8 790 aa3.77□□□□□ -1.81
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